NVIDIA携手Evozyne 创建用于生成蛋白质的生成式AI模型,助力新药研发

医药 来源:医谷网
2023
01/13
11:07
医谷网 医药

近日,在摩根大通医疗健康大会上,初创企业Evozyne宣布使用NVIDIA提供的预训练AI模型,创造了两种在医疗和清洁能源领域具有重大潜力的蛋白质。其中,一种蛋白质用于治疗一种先天性疾病,另一种用于消耗二氧化碳以减少全球变暖,日前发布的一篇联合论文描述了这一过程及产出的蛋白质氨基酸序列。

Evozyne联合创始人、论文共同作者Andrew Ferguson表示:“令人欣喜的是,NVIDIA的AI模型第一轮产出的合成蛋白质就像自然生成的蛋白质一样,这意味着该模型已经学会了自然界的设计规则。”

革命性的AI模型:学会如何自然地构建蛋白质氨基酸序列

据了解,Evozyne在创造蛋白质的过程中用到了NVIDIA的ProtT5。ProtT5是一款Transformer模型,主要用于创建医疗AI模型的软件框架和服务,也是属于NVIDIA药物研发框架BioNeMo的一部分。

一直致力于化学和机器学习研究领域的分子工程师Ferguson表示:“BioNeMo非常强大,能让我们训练模型,且在以非常低的成本使用该模型来运行工作任务的同时,在几秒钟内就能生成数百万个序列。”该模型也正是Evovyne ProT-VAE流程的核心,ProT-VAE是一个工作流,其将BioNeMo与作为过滤器的变分自编码器(VAE)相结合。

“这在几年前简直难以想象,因为那时还没有人注意到可以使用大型语言模型与变分自编码器相结合的方式来设计蛋白质。”Ferguson说道。

事实上,就如同人读万卷书,NVIDIA的Transformer模型会读取数百万种蛋白质中的氨基酸序列,其运用神经网络用来理解文本的技术,学会如何自然地构建蛋白质氨基酸序列,这也正是其如何预测并创造了能够满足Evozyne需求的新蛋白质的关键所在。

Evozyne方面表示:这项技术正在助力我们开展工作,以实现十年前无法实现的梦想。

缩短训练时间扩大模型规模 未来可期

目前,传统的蛋白质工程设计方法采用定向进化,即一种缓慢、无计划的方法,该方法通常一次只改变几个氨基酸的序列。而如何通过更高效精准的机器学习来提升研究海量氨基酸组合的可行性,并有效地识别最有用的序列,是NVIDIA一直在专注的领域,该生物学难题的解决,将对生命科学和医学带来很大益处,尤其对于医学领域,这将极大地加快了解细胞组成部分的工作,并使更好更先进的药物被更快地发现成为可能。

Evozyne的ProT-VAE流程就采用了NVIDIA BioNeMo中强大的Transformer模型,生成有用的蛋白质,进而助力药物研发和能源领域实现可持续性。

通过使用Transformer模型,Evozyne的方法只通过一轮就能改变一个蛋白质中半数乃至以上的氨基酸,这相当于进行了数百次的突变。

Evozyne表示:“我们正在实现技术上的飞跃,这使我们能够探索以前从未见过的、具有有用的新功能的蛋白质。“

同时,Evozyne还披露,通过与NVIDIA的合作,他们已能够训练出原本不可能训练出的模型,比如一些有数十亿可训练参数的模型。同时,他们还计划使用新的工艺来构建各种能够对抗疾病和气候变化的蛋白质。”使用AI加速蛋白质工程的前景十分广阔,我们很期待未来的进一步发展。“

来源:医谷网

行业重磅内容、政策信息及时获取,扫码关注医谷微信公众号

为你推荐

用于治疗套细胞淋巴瘤,全球首款非共价BTK抑制剂获FDA加速批准上市资讯

用于治疗套细胞淋巴瘤,全球首款非共价BTK抑制剂获FDA加速批准上市

日前,礼来宣布,美国FDA加速批准了Jaypirca(pirtobrutinib,100mg和50mg片剂)上市,用于既往接受过至少二线系统治疗后((包括布鲁顿酪氨酸激酶(BTK)抑制剂))复发或难治性套...

2023-01-28 15:12

全球首个CRISPR-Cas9基因编辑疗法要上市了资讯

全球首个CRISPR-Cas9基因编辑疗法要上市了

近日,CRISPR Therapeutics和Vertex两家公司宣布,欧洲药品管理局(EMA)已受理其递交的CRISPR基因编辑疗法exagamglogene autotemcel(ex

2023-01-28 14:59

中疾控公布全国新型冠状病毒感染疫情情况资讯

中疾控公布全国新型冠状病毒感染疫情情况

近日,中国疾控中心发布全国新型冠状病毒感染疫情情况,数据显示,在院新冠病毒感染死亡病例数于1月4日达到每日峰值4273例,随后持续下降,1月23日下降至896,较峰值下降79 0%。

2023-01-28 14:01

辉大基因首个基因治疗药物获FDA批准开展临床试验资讯

辉大基因首个基因治疗药物获FDA批准开展临床试验

今日(1月28日),辉大(上海)生物科技有限公司(以下简称“辉大基因”)宣布,其自主研发的眼科基因治疗候选药物HG004获得美国食品药品监

2023-01-28 13:30

凭借显著优效性及安全性,新一代BTK抑制剂百悦泽美国获批CLL/SLL适应症资讯

凭借显著优效性及安全性,新一代BTK抑制剂百悦泽美国获批CLL/SLL适应症

这是泽布替尼三年多的时间在美获得的第四项上市批准

2023-01-20 15:02

罗氏宣布肝癌辅助治疗IMbrave050研究中期分析达到主要终点资讯

罗氏宣布肝癌辅助治疗IMbrave050研究中期分析达到主要终点

1月19日,罗氏制药宣布,在预设的中期分析中,肝癌辅助治疗III期研究IMbrave050达到了主要终点——无复发生存期(RFS)。IMbrave050研究旨在评估PD-L1免疫抑制剂阿替利珠单抗(...

2023-01-20 09:42

安斯泰来在2023年美国临床肿瘤学会(ASCO)胃肠道肿瘤研讨会上公布Zolbetuximab三期试验积极研究结果资讯

安斯泰来在2023年美国临床肿瘤学会(ASCO)胃肠道肿瘤研讨会上公布Zolbetuximab三期试验积极研究结果

1月19日,安斯泰来制药集团宣布了旨在评估Zolbetuximab联合mFOLFOX6(一种包括奥沙利铂、亚叶酸钙和氟尿嘧啶联合用药方案)一线治疗Claudin 18 2 (CLDN18 2)阳性、HER2阴性...

2023-01-20 08:58

国内首个晚期一线绝经前乳腺癌CDK 4/6 抑制剂凯丽隆在华获批 资讯

国内首个晚期一线绝经前乳腺癌CDK 4/6 抑制剂凯丽隆在华获批

与芳香化酶抑制剂联合用药,作为激素受体(HR)阳性、人表皮生长因子受体2(HER2)阴性局部晚期或转移性乳腺癌绝经前或围绝经期女性患者的初始内分泌治疗,使用内分泌疗法治疗时...

2023-01-19 21:05

翰森制药多款创新药及新适应症纳入2022年国家医保药品目录资讯

翰森制药多款创新药及新适应症纳入2022年国家医保药品目录

1月18日,国家医保局与人力资源社会保障部公布了《国家基本医疗保险、工伤保险和生育保险药品目录(2022年)》(以下简称“医保目录”),阿美乐(甲磺酸阿美替尼片)一线治疗适...

2023-01-19 15:59

欧狄沃获批成为中国首个且目前唯一用于尿路上皮癌辅助治疗的免疫疗法资讯

欧狄沃获批成为中国首个且目前唯一用于尿路上皮癌辅助治疗的免疫疗法

与对照组相比,欧狄沃用于肌层浸润性尿路上皮癌辅助治疗可使全人群患者的中位无病生存期(DFS)翻倍。

2023-01-19 13:54

华毅乐健AAV基因疗法获批IND,治疗A型血友病资讯

华毅乐健AAV基因疗法获批IND,治疗A型血友病

近日,CDE官网信息显示,由著名生物学家饶毅创立的苏州华毅乐健生物科技有限公司(以下简称“华毅乐健”)的AAV基因疗法GS1191-0445注射液

2023-01-19 10:12

首次复发治疗创新靶向药凯洛斯被纳入国家医保目录资讯

首次复发治疗创新靶向药凯洛斯被纳入国家医保目录

023年1月18日,新版国家医保目录(2022版)正式公布,多种创新性高、临床价值高、疗效确切的药物被纳入新版医保,帮助更多中国患者获得及时有效的治疗。值得一提的是,多发性骨...

2023-01-19 09:49

脊髓性肌萎缩症口服创新药物艾满欣纳入国家医保目录资讯

脊髓性肌萎缩症口服创新药物艾满欣纳入国家医保目录

艾满欣于 2021年6月获国家药品监督管理局正式批准,用于治疗2月龄及以上SMA患者,成为首个在中国获批治疗SMA的口服疾病修正治疗药物。

2023-01-19 09:05

“简易续约”新规下,奥拉帕利成功纳入2022版国家医保药品目录资讯

“简易续约”新规下,奥拉帕利成功纳入2022版国家医保药品目录

昨日(1月18日),国家医保局公布了2022年医保药品目录调整结果,与前几年相比,本次符合条件的新适应症“简易续约”新规是医保续约规则的亮点之一,它兼顾了药物的经济性和有效...

2023-01-19 09:02

某罕见病药品从6.38万降到3780元,多款“全国首款”、“全球首款”在列,2022国家医保谈判结果发布(附完整版目录下载链接)资讯

某罕见病药品从6.38万降到3780元,多款“全国首款”、“全球首款”在列,2022国家医保谈判结果发布(附完整版目录下载链接)

此次的新版医保目录比以往来得更晚一些,昨日晚间(1月18日),2022年版国家医保药品目录调整名单正式公布。

2023-01-19 08:05

德谷胰岛素利拉鲁肽注射液(诺和益)被纳入2022年国家医保目录的背后资讯

德谷胰岛素利拉鲁肽注射液(诺和益)被纳入2022年国家医保目录的背后

1月18日,国家医保局公示了国家医保药品目录的结果,我们发现受到临床高度关注的德谷胰岛素利拉鲁肽注射液(Insulin Degludec Liraglutide Injection, 简称IDegLira)进入《...

2023-01-18 21:58

中国唯一第三代BCR-ABL抑制剂奥雷巴替尼片(耐立克)成功纳入2022版国家医保药品目录资讯

中国唯一第三代BCR-ABL抑制剂奥雷巴替尼片(耐立克)成功纳入2022版国家医保药品目录

耐立克是中国首个且唯一获批上市的第三代BCR-ABL抑制剂,也是伴T315I突变慢粒的唯一治疗药物。

2023-01-18 19:04

单片双药HIV治疗药物多伟托稳定转换适应症纳入国家医保目录资讯

单片双药HIV治疗药物多伟托稳定转换适应症纳入国家医保目录

多伟托是《中国艾滋病诊疗指南(2021年版)》一线推荐药物2,由固定剂量的多替拉韦(50mg)和拉米夫定(300mg)组成。

2023-01-18 18:22

多发性硬化创新药物特菲达(富马酸二甲酯)纳入医保资讯

多发性硬化创新药物特菲达(富马酸二甲酯)纳入医保

新版医保目录的正式实行,将显著提高富马酸二甲酯肠溶胶囊的可及性,大幅度降低患者用药经济负担,进一步助力中国患者长期规范疾病管理。

2023-01-18 18:03

金斯瑞蓬勃生物宣布进行约2.2亿美元C轮融资资讯

金斯瑞蓬勃生物宣布进行约2.2亿美元C轮融资

本轮融资是2022年下半年以来国内最大规模的生物医药合同研发生产(CDMO)产业融资,由多支活跃在生物医药投资领域前沿的投资机构参与。

2023-01-18 17:23