最近,著名研究机构博德研究中心宣布与IT巨头Intel公司签订了一份为期五年,总价值达2500万美元的合作协议,该协议致力于在未来五年内整合现有私人、公众以及云平台上的基因组数据以加速生命科学领域研究。
双方此次的合作反映出了目前世界各个科研单位面对日益增长的生物信息学数据处理能力不足的庞大压力。通过这一合作,博德研究中心希望能够将自身数据与外界数据相结合,打造一个更加统一的生物信息学平台。
按照协议,双方将进行三方面的合作。首先,Intel将为博德中线拥有的基因组分析工具GATK量身定做合适的硬件设施,建立包括公共云平台在内的硬件环境。这一项目旨在降低该中心在利用和分析不同来源基因组数据时可能遇到的困难。此外,博德研究中心还将在Intel的帮助下改造现有的软件工具,如其工作流运行引擎Cromwell以及GenomicsDB,以保证这些工具能够在Intel基础的计算平台上兼容。这一软件优化将能够进一步加强中心对相关数据的处理能力。最后,双方还希望帮助生物医药公司、学术机构以及医疗保险提供者在内的多个使用者打造一个基因组数据共享平台。为了实现这一目的,Intel和博德研究中心将开发新的工作流执行模型以支持和分流数据。如果这一计划得以实现,研究人员相信将会为药物研发以及临床诊断带来巨大变革。
近年来随着计算机技术与生命科学技术的交融,类似的合作协议早已成为潮流。就在几天前,博德研究中心还宣布与IBM合作,收集和分析超过10000例肿瘤药物抗药性患者基因组信息并进行肿瘤抗药性机制研究并助力未来新型疗法的开发。
可以预见,掌握了更强大计算技术的生命科学研究人员将会为人类健康进步作出更大贡献。
原文检索
《Broad, Intel start $25M genomic data integration project》
来源:生物谷
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