采血检测癌症基因组，日本在胰腺癌方面取得成果

医疗器械 2015-12-22 14:47 来源：日经技术在线作者：大下淳一

2015

12/22

14:47

日经技术在线

作者：大下淳一

医疗器械

日本国立癌症研究中心开发出了无需通过活检或手术采集组织、而是利用血液来进行高精度全面基因组分析的方法。这是被称为液体活检（Liquid biopsy）的检查技术中的一种新方法。该研究中心使用这种方法，成功检测出了可能会成为晚期胰腺癌治疗靶点的异常基因。这一成果有助于实现患者负担小而且效果好的个体化治疗。

国立癌症研究中心研究所癌症基因组科学研究领域负责人柴田龙弘与该部门负责人谷内田真一等人组成的研究小组此次通过验证证实，可利用10ng的微量血液循环（游离）DNA，通过新一代测序仪进行全面性的基因组分析。据介绍，以往的基因组分析最少需要200ng的DNA。血液循环DNA的含量很少，而且高度分裂，因此以前的技术很难利用血液循环DNA进行高精度的基因组分析。

国立癌症研究中心此次开发出了结合使用现有分析套件的新型预处理法。还改进了序列数据分析方法，因此只需使用原来1/20的血液循环DNA便可进行高精度的基因组分析。

捕捉可能会成为治疗靶点的异常基因

此次在研究中进行的尝试是，使用通过组织活检等方法诊断出胰腺癌的患者的血液，来检测胰腺癌中频繁发现异常的基因，以及含有可能成为治疗靶点的基因的胰腺癌异常基因组。

在胰腺癌中，人们发现通过使用手术标本来进行大规模基因组分析，可以频繁地检测出“KRAS”、“CDKN2A”、“TP53”、“SMAD4/DPC4”四种基因异常。其中，KRAS基因突变是致癌过程的最初阶段产生的基因组异常，95％以上的胰腺癌患者都会携带这种变异基因。

在检测出KRAS变异的病例中，患者的血液中通常会存在来源于肿瘤组织的血液循环DNA。此次以这种病例为主，针对48个病例，利用新一代测序仪分析了60种基因，包括胰腺癌中频繁出现变异的基因以及可能会成为治疗靶点的基因。

结果在所有病例中都检测出了1种以上的癌症体细胞基因突变。而且，在其中14（约占30％）个病例中发现了可能成为治疗靶点的“PIK3CA”、“EGFR”、“ATM”等基因变异。

此次国立癌症研究中心还自主开发出了根据序列数据来推测基因扩增的算法。众所周知，在癌症中，分子治疗靶点——肿瘤基因会扩增。此次该研究中心也在晚期胰腺癌患者身上检测出了在其他癌症中发现基因扩增、可能会成为治疗靶点的“ERBB2（HER2）”及“CCND1”等基因扩增。

将来有望进行分子靶向药物治疗

据介绍，不仅是胰腺癌，此次的分析方法适用于所有实体癌症。而且对于病情不适合进行活检的患者，以及耐药变异等随着时间变化需要进行多次检查的情况也非常有用。该技术有望成为患者负担小于组织活检的全面性基因组分析方法。

此次针对胰腺癌的验证表明，基于癌症基因异常的个体化治疗可能也对此前分子靶向药物开发没有取得进展的胰腺癌有效。今后，进一步提高检测灵敏度之后，还有望应用于难治癌症的早期诊断。

此次的成果已于2015年12月16日刊登在英国科学杂志《自然》（Nature）子刊——网上科学杂志《Scientific Reports》上。

来源：日经技术在线作者：大下淳一

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