Grail推出ctDNA图谱研究计划，以支持癌症早期检测的开发

医疗健康 2016-12-09 14:49 来源：测序中国（微信号 seq114）作者：iseqer

2016

12/09

14:49

测序中国（微信号 seq114）

作者：iseqer

医疗健康

液体活检公司Grail上周表示，他们正在推进一项雄心勃勃的计划，全面地分析至少10,000人的循环DNA。这是自今年1月成立以来，Grail透露的关于如何开发泛癌症早期检测的第一个细节。

Grail推出CCGA计划，分析ctDNA的异质性

他们的目标是创建一个循环游离DNA图谱（circulating cell-free DNA atlas，CCGA），描述和比较健康人与癌症患者的ctDNA的异质性或变异性。该图谱将支持Grail的检测产品开发计划，使其能够精确地对检测产品进行调整，以在健康人中识别指示肿瘤正在形成的模式。

为了创建CCGA，Grail正在与多个学术中心合作，招募总计10,000名受试者，使用全面的靶向panel和超深度测序策略对其血液样本进行分析。该公司计划追踪受试者五年，分析其循环DNA模式和水平的变化。在这个研究队列中，7,000名受试者将是癌症患者，另外3,000名受试者是健康对照。

Grail的CEO Jeff Huber表示，公司使用的测序分析方法将覆盖数百个基因，比该领域中其他公司目前使用的大一个数量级，但他没有提供确切的关于覆盖哪些基因组区域的详细信息。而且，他们的测序深度也比其他公司深一个数量级。

Huber说，“癌症早期检测的挑战主要有两点：一个是癌症异质性，鉴于异质性和我们想要在其最早阶段检测癌症的事实，我们必须非常广泛地研究基因组，以找出突变发生在哪里，并能够检测到。另一个是深度，我们的目标是能够在一个血样中检测到能够在最早阶段指示癌症的一些分子，所以我们的测序深度比其他公司都深一个数量级。我们每个检测样本可产生TB级的数据。”

目前，Grail已有的合作者包括：Guardian研究网路、梅奥诊所和哈特福德医疗保健癌症研究所。CCGA研究将最终包括四十多个临床试验站点。

验证其测序panel识别癌症最早期信号的能力

在该研究的10,000名受试者阶段，该公司将重点比较健康人群与具有不同阶段和类型癌症患者中循环cfDNA模式的异质性或多样性。

初始阶段公司将不在具有风险的人群中测试他们的检测。随着研究的推进，公司将验证他们的panel识别癌症最早期信号的能力。

Huber说，“对一个诊断检测，需要先了解它的假阳性率和假阴性率。所以，我们在一个大型健康对照人群中，先确保它有非常低的假阳性率和假阴性率。”

Huber表示Grail创立的初衷要求他们在确定其检测的临床效用前，需要在不仅10,000名，甚至需在数十万名受试者中进行验证。

除了计划对数十万受试者进行测序，Grail也在开发信息和数据的基础设施，为机器学习和其他所需的能力打基础，这使他们认为自己正在应对其他液体活检公司没有面临的挑战。

Grail还需考虑的是，这项依赖于广泛和深度测序的检测用来筛查大量无症状人群的成本问题。该公司认为，随着测序技术和计算/数据存储的成本下降，如果他们在未来四年到五年间推出检测产品，成本是可接受的。

来源：测序中国（微信号 seq114）作者：iseqer

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