6月6日,路透社报道称,为了在人类DNA数据存储服务市场和医学研究领域掌握话语权,亚马逊已经与谷歌展开竞赛。
业内人士表示,学术研究机构和医疗公司将选择在Google Genomics和亚马逊云服务之间站队。为了赢得备受瞩目的基因组研究业务,双方你追我赶。
个体化治疗正在推动人类DNA数据存储服务市场增长。个体化治疗方案可以依据病人的DNA信息选择治疗方法。为此,我们需要大量的DNA数据,以发现不同治疗方法与具体基因信息之间的关系。
目前,美国大学和药品制造商正在对数十万人的基因组进行排序。人类基因组是包含在人类DNA中的全部遗传信息,几乎每一个人体细胞都包含同样的基因信息。
在基因数据存储方面,谷歌和亚马逊的数据处理、安全性、成本控制和分享能力胜过学术机构和医疗公司。除了存储服务,两家云计算公司还提供数据分析服务,旨在让科学家利用DNA数据。微软和IBM同样计划进军这个市场。
投资银行FBR Capital分析师尼尔·艾夫斯(Daniel Ives)预计,目前全球云基因市场规模约为1亿至3亿美元,到2018年这个数字将增长到10亿美元。届时,整个云计算市场年营收将达500亿至750亿美元,高于现在的300亿美元。
美国生物学家克莱格·凡特(Craig Venter)表示:“云计算是该领域的全部未来。”1990年代,凡特的公司开始测序人类基因组序列。
凡特表示,以前的数据传输方法非常落后,科学家必须通过联邦快递和专人运送磁盘和U盘,有时还要亲自跑一趟。现在,凡特的公司已经使用亚马逊云服务。
美国制药公司Regeneron Pharmaceuticals和医疗机构Geisinger Health Systems还合作测序了250000个基因组序列。这些DNA数据被上传到亚马逊云服务。
免费存储
为了展现谷歌和亚马逊对这项业务的重视程度,以及对现有客户的重视程度,两家公司为知名基因组项目提供免费存储服务。
谷歌和亚马逊都没有公布基因组信息存储量,但根据分析师、基因科学家和公司披露的相关数据,亚马逊云服务可能略胜一筹。
作为“千人基因组计划”项目的一位赞助人,美国国立卫生研究院的凯西·克莱文迪(Kathy Cravedi)表示,“千人基因组计划”项目数据同时免费存储于谷歌和亚马逊的服务。
但是,付费客户往往选择一款存储服务。
例如,谷歌赢得了来自自闭症之声(Autism Speaks)的一个项目,该项目旨在收集和分析10000名自闭症儿童和他们父母的基因信息。谷歌的另一个付费客户是基因数据创业公司Tute Genomics。
亚马逊为Multiple Myeloma Foundation的项目提供存储服务,该项目旨在为新型药物靶标提供病人基因信息。亚马逊还赢得了Alzheimers Disease Sequencing Project项目。
亚马逊每月针对每个完整的人类基因组收取大约4至5美元费用。谷歌的月费约为3至5美元。当科学家利用分析软件处理存储数据,两家公司还针对数据传输或计算时间收费。
亚马逊数据库分析工具Redshif按照25美元/小时或1000美元/TB/年计费。1 TB空间足以存储300小时时长高清视频。
基因黄金
云服务还有另一个优势,就是它们的分析工具可以在基因组数据中“淘出黄金”,即预测疾病风险的DNA变异。所有基因黄金都属于数据拥有者。
Alzheimers Disease Sequencing Project项目负责人杰拉德·舍伦贝格(Gerard Schellenberg)表示,在大学服务器上,执行一次数据分析可能需要数月时间。但在亚马逊服务器上,“你想多快就多快”。
云服务的另一个卖点是安全性。计算器安全公司Cylance首席科学家瑞安·帕玛(Ryan Permeh)表示,大学服务器存在很多漏洞。
Google Genomics工程主管大卫·格雷泽(David Glazer)认为,目前学术和药物研究项目是基因云服务的最大客户,但未来10年临床应用规模将超过它们。
未来,医生可以定期进入云服务,了解病人基因信息引起各类疾病的风险,或者选择适合病人的治疗方案。
“我们现在处在这个拐点之上。”格雷泽说道。
亚马逊云服务数据科学部门经理马特·伍德(Matt Wood)认为,基因组数据非常庞大,科学家需要协同研究这些数据,而且基因组进入临床治疗的速度也在加速,基因组云服务的需求将飞速增长。
DNA研究专家认为,如果没有云服务,现代基因组学就会止步不前。
来源:腾讯科技
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