英国Oxford Nanopore公司自2014年春季开放试用计划以来,收效还不错。多名用户使用MinION测序仪之后,在顶级杂志上发表了研究成果,并对测序仪的性能表示满意。近日,Oxford Nanopore计划扩大早期试用计划,并首次公布了流动槽的售价。
Oxford Nanopore上个月表示,它计划通过MinION试用计划(MinIon Access Program)出售MinION测序仪。客户只需加入MAP,并支付1000美元,就能获得MinION MkI设备和一个启动试剂盒,包括三个流动槽、两个试剂盒、软件以及定期的免费耗材。
上个月,Oxford Nanopore在伦敦举行了London Calling用户会议,发布了MinION MkI测序仪,这是MinION测序仪的升级版。据介绍,它的性能和易用程度都得到了改善,包括温度控制更佳,并以一种改良的方式连接流动槽。
用户除了等待免费的流动槽,也可以自行购买。Oxford Nanopore也公布了流动槽的售价。若单买一个流动槽,价格为900美元。若打包购买,价格自然会便宜一些。Oxford Nanopore提供12、24和48个的包装,每个流动槽的价格最低为500美元。
Oxford Nanopore没有指定每个流动槽的最高产量,这会随着版本的更新而增加。运行时间也不是固定的,因此产量取决于运行的长短。去年,该公司表示,其内部记录是每个流动槽1 Gb,而有些客户实现了每个流动槽超过500 Mb。
同时,这家公司还计划引入快速模式,这能够将数据产量提高10倍,而两个月后这个数字可能提高到17倍。在正常模式下,每秒可读取30个碱基;而在快速模式下,每秒读取500个碱基。快速模式让MinION MkI的产量达到40 Gb。
至于如何加入MinION试用计划,Oxford Nanopore网站上有详细说明。申请者需要在网站上填写报名表,阅读相关的条款和条件,并支付1000美元的费用和适当的运费,即可获得MinION测序仪。在收到仪器之后,用户需要使用附带的lambda样本开展“褒机”实验。如果实验的结果满意,你需要通知Oxford Nanopore,之后使用自己的样本。如果不满意,你可以选择退出。
目前,MinION测序仪支持多个应用,包括基因组DNA、cDNA和扩增子测序。同时,Oxford Nanopore也鼓励用户开发更多的新应用。
来源:生物通 作者:余亮
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