张锋发表了一项关于单细胞测序的进展_医疗健康

2016

08/03

09:35

生物探索医疗健康

大牛张锋又在Science杂志上发表新成果啦。不过，这次的进展不是与CRISPR相关，而是“跑”到了单细胞测序领域。当然，在CRISPR领域，他也没“闲着”，也有一项成果发表在Journal of Biological Chemistry杂志上。

7月28日，发表在《科学》（Science）杂志上的这项研究中，来自MIT的科学家们报道了单细胞测序领域的一项新进展。他们开发一种名为的Div-Seq新方法，可用于大脑中罕见细胞类型的研究。张锋与Aviv Regev是这一研究的共同通讯作者。

新技术：Div-Seq

每一个细胞，不管看起来与它的“邻居”多么相似，但都有自己响应环境的方式。这种独特性是由基因表达决定的。每个细胞中的基因如何表达决定了它在人体中的职能。

在过去的几年中，单细胞测序技术飞速发展，使科学家能够以前所未有的分辨率观察细胞内的基因表达。借助这一变革性的技术，研究人员能够检测细胞群的异质性，鉴定罕见细胞，观察不同细胞类型之间的相互作用，更好的了解这种互相作用对健康和疾病的影响。

在Science上发表的这项研究中，MIT的科学家们利用Div-Seq这一技术对增殖的单个细胞进行研究，不仅能够鉴定出密切相关的海马细胞类型，还能够追踪新生神经元的转录动力学。研究人员还利用Div-Seq鉴定和描述了成人脊髓中罕见的新生GABAergic神经元。

这一成果发表后，Broad研究所网站发布了对共同第一作者Naomi Habib以及Yinqing Li的采访。Li说：“神经精神疾病（Neuropsychiatric diseases）往往过于复杂，很难找到有效的治疗方法。只有当我们在单细胞水平对每个神经元类型有完整的了解，才能开发靶向性更明确的疗法。”

Li还强调，因为这一方法专门设计用于解决神经元方面的挑战，因此，与利用之前的单细胞技术获得数据截然不同。因而，科学家们还开发了一个新的计算工具，用以充分揭示这些数据背后的信息。

应用前景

Habib表示：“我们的方法使得探索复杂的组织变得更加简单。很重要的一点是，它适用于冷冻或固定的组织，这为研究人类样本提供了可能。Div-Seq技术还为观察成人神经形成的罕见过程和其它再生过程提供了新的方法。同时，这一技术还可以用于观察给定组织中正在分裂的细胞，追踪基因表达的变化。”

Li认为，随着对细胞类型和特征的理解，我们可以开始问这样的问题：哪种细胞表达了疾病相关的基因？这些细胞位于大脑中的哪个部位？这些细胞中还表达了其它哪些基因，哪个能作为潜在的药物靶点？

Habib补充道：“我们的方法还支持很多应用，比如，描绘大脑中对学习和记忆非常重要的区域的细胞多样性。了解细胞在分子水平上的正常状态，以及每个细胞类型问题会出在哪里，能够促进我们对疾病的理解，帮助寻找治疗方案。”

来源：生物探索

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