2026年1月13日,因美纳公司(纳斯达克股票代码:ILMN)推出全球最大的、覆盖全基因组的遗传扰动数据集,旨在通过人工智能加速整个制药生态系统的药物发现进程。因美纳 “十亿细胞图谱”(Illumina Billion Cell Atlas)是其在三年内构建“五十亿细胞图谱”计划的首批成果,将成为迄今为止最为全面的人类疾病生物学图谱。
在与阿斯利康、美国默克公司和礼来公司等作为发起参与方组成的联盟框架下,该图谱已开始针对一组经甄选的细胞系开展构建工作,以推动药物靶点验证、大规模训练先进AI模型,并推进此前难以触及的基础疾病机制研究。“
我们相信,细胞图谱是推动AI在药物发现领域实现显著规模化的关键进展。” 因美纳首席执行官Jacob Thaysen表示。 “我们正在构建一项业内领先的训练资源,用于新一代AI模型,服务于精准医疗与药物靶点识别,最终帮助绘制全球最具破坏性疾病背后的生物通路。”
美国默克公司将利用该图谱加速其在药物发现管线中的精准医学研发策略。这些数据将用于训练美国默克公司自研的AI/ML基础模型并构建虚拟细胞模型,旨在提升对疾病适应症的预测能力。
“通过利用先进的患者基因组数据集,美国默克公司的科学家正在构建并运用基于真实生物学变异,而非仅仅依赖文献语料的AI模型,并将这些洞察转化为能够真正惠及患者的全新靶点与精准生物标志物。” 美国默克公司数据、人工智能与基因组科学副总裁兼负责人Iya Khalil表示,“通过与因美纳的紧密合作,我们正在建立一座可扩展的桥梁,将基因组洞察转化为治疗影响,加速从发现到临床的路径,并以前所未有的信心与速度深化我们对复杂疾病生物学的理解。”
人工智能与人类基因组学形塑生物医药发现的新前沿
该图谱将记录在超过200种疾病相关细胞系中,10亿个细胞个体对通过CRISPR引入的遗传改变的响应。这些细胞系因与疾病的相关性而被选取,其中许多疾病长期以来难以解码,包括免疫系统疾病和癌症,以及心脏代谢、神经系统和罕见遗传性疾病。CRISPR技术使研究人员能够在遍布全身的关键细胞类型中,快速研究对全部20,000个基因进行激活或抑制所产生的效应。
该图谱将帮助用户表征药物与疾病的作用机制,探索潜在的新适应症,并基于人类遗传学验证候选靶点。
“将遗传信息转化为对疾病机制的清晰理解,并最终转化为药物,这仍然是研发领域的核心挑战,”阿斯利康基因组研究中心副总裁Slavé Petrovski表示。“通过揭示特定遗传扰动在人体细胞中如何发挥作用,我们能够把遗传信号转化为可直接研究的生物学机制,从而为药物开发决策带来更清晰的依据。”
“新一代由AI驱动的药物发现将以前所未有规模的生物学数据为依托,”礼来公司心脏代谢研究事业部集团副总裁Ruth Gimeno表示。“覆盖多种细胞类型的综合性数据集,为产生关于人类疾病的有意义洞察提供了关键基础。”
BioInsight 团队如何构建因美纳首个数据产品
“十亿细胞图谱”是因美纳新业务部门BioInsight推出的首个数据产品。如此规模依托Illumina Single Cell 3' RNA prep产品的强大能力,单次实验可捕获数百万个单细胞。该图谱将以一年内20 PB的速率产出单细胞转录组数据。为处理如此海量的数据,单细胞RNA测序数据将采用具备硬件加速的因美纳DRAGEN分析流程进行处理,随后托管在Illumina Connected Analytics云平台上开展可扩展分析。
因美纳新成立的BioInsight业务部门旨在为制药领域的新一代药物发现与AI应用提供基础性技术与数据集。通过推出因美纳“十亿细胞图谱”,并开发面向特定疾病的综合基因扰动数据集,结合先进的AI算法,因美纳正在推动新一代细胞建模的进展。
因美纳正与其合作伙伴携手,不断扩展“数十亿规模细胞图谱”。此次“十亿细胞图谱”建立在因美纳于2025年2月宣布的合作倡议之上,其最终目标是创建一个“五十亿单细胞图谱”。
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