聚焦数据、算力和体验,亚马逊云科技发力医疗与生命科学行业

医疗健康 来源:医谷网 作者:张蓉蓉
2023
05/09
21:59
医谷网
作者:张蓉蓉
医疗健康

云计算、大数据和人工智能等技术是加速医疗与生命科学行业实现数字化转型和发展的重要途径。日前,在亚马逊云科技医疗与生命科学行业峰会上,亚马逊云科技大中华区战略业务发展部总经理顾凡带来了“云计算加速行业创新”的主题分享。他表示,作为医疗与生命科学行业数字化转型和创新的推动者和支持者,亚马逊云科技正围绕数据、算力和行业用户体验三大需求发力,通过持续构建行业专属解决方案,进一步赋能生物制药、基因测序和医疗保健等细分领域的数字化创新,加速推进创新成果从实验室到真实世界的落地。

据悉,早在2013年,亚马逊云科技就组建了全球范围的医疗和生命科学专业团队,并联合数百家合作伙伴,服务包括辉瑞、拜尔、罗氏、默沙东、飞利浦等头部企业在内的4200多家行业用户。目前,全球前十大药企中,九家使用亚马逊云科技。在中国,亚马逊云科技也与数十土合作伙伴携手,共同服务超过400家用户。

聚焦三大挑战,推出细分领域解决方案

基于对生物制药、基因测序和医疗保健领域用户需求的长期关注,亚马逊云科技发现三大共同挑战:

一是日益增长的海量数据。根据自然杂志预估,随着测序技术的发展,基因测序的数据量急剧增加,到2025年,每一年的基因数据增长将超过40EB;药物发现领域,科学家需要在10的60次方已知化合物里找到可能成药的化合物;医疗领域,一人一次的CT数据量超过30MB,综合医院的CT数据增量往往超过10GB/天。

二是持续而迅速的算力需求。高性能计算在医疗及医药行业中的应用越来越广泛,例如虚拟筛选是计算机辅助药物研发流程的关键步骤,即对数亿种已知化合物是否能够与病毒蛋白质(靶点)结合进行分析,而基因测序需要在30亿个组合的碱基对中寻找变异,医学影像领域则需要借助机器学习算法进行辅助诊断以发现肉眼难以识别的病灶位置。

三是需要快速构建适合行业用户体验的创新解决方案。如今,医疗和生命科学行业用户,希望快速地使用符合自身需求的即开即用的解决方案,以更快发现更好的药物,开发更智能的医疗设备,及为患者提供更加有效的治疗方案。

为了帮助用户克服上述挑战,亚马逊云科技开发了多个行业解决方案。其中,基于高性能计算(HPC)的人工智能新药研发服务解决方案使研究人员能够在亚马逊云科技上组建数百万个vCPU的高性能计算平台,以开展数十亿蛋白质分子规模的药物发现研究。以十亿个分子的化合物分析为例,单核服务器需要475年,而在亚马逊云科技上只需要1天,此外,亚马逊云科技还推出了“量子计算探索之药物发现方案”,该方案提供了一键部署的量子计算/经典计算混合架构,通过Amazon Braket量子计算平台调用量子计算资源进行实验,为量子计算在药物发现方面的应用探索新思路。

面向基因测序领域,亚马逊云科技的数据全生命周期管理解决方案能够为基因分析不同阶段的生物信息学数据的存储、调用和分析提供更好的性价比和更高可用性。该解决方案包括数据上传、数据分析、数据共享和数据备份及存档全生命周期。Amazon S3对象存储能够提供八层存储,再加上自动分层功能,能够更高效地存储数据和实现成本节约。

另外,亚马逊云科技还在2022年re:Invent期间推出了Amazon Omics服务,这项用于存储、分析和阐述基因组学、转录组学和其他组学数据的托管服务,能够兼顾具体应用场景下的智能存储与调度需求,能够帮助客户快速进行基因分析研究,加速新药研发、疾病诊断和治疗。

值得一提的是,亚马逊云科技还为医疗行业的客户提供了云上高性能计算平台。通过亚马逊云科技的云上HPC,机器学习,量子计算等方式,大幅提升虚拟筛选等计算机辅助药物研发流程的效率,包括化合物与病毒蛋白质结合的分析,基因测序中寻找碱基对变异,以及在医学影像领域发现肉眼难以识别的病灶位置等等。

以“未知君”为例,该公司专注于肠道微生态治疗,在其研究的微生态领域,仅一个研究样本就会消耗100G到200G的存储容量。随着基因测序和分析项目的增多,每个项目都会生成海量数据,对数据的存储、管理和处理极大增加了容量和计算量,不必要的延迟带来的时间消耗对未知君的研发业务造成了影响。同时,计算与存储成本也超出负荷。通过亚马逊云科技提供的自动化数据生命周期管理服务,该公司将不同的数据分级存储、归档到成本极低的存储层中,有效降低存储成本,并实现了TB级基因数据的存储,同时还应对了团队不断增长的存储需求。

携手多方力量,丰富行业数字化创新生态链

多年来,亚马逊云科技不断丰富行业数字化创新生态链,不仅与APN合作伙伴网络成员联手为各种创新场景提供端到端解决方案,同时还在亚马逊云科技Marketplace上推出可以快速部署和使用的工具和服务,且亚马逊云科技还开放了96种生命科学公开数据集,涵盖生命科学、基因、重疾以及新冠研究等重要领域。

2011年10月,位于医疗资源密集的上海市徐汇区的上海亚马逊云科技生命健康数字化赋能中心正式投入运营,该中心设置的卓越展示中心、协同服务云平台、行业俱乐部、全球合作计划能够为生命健康企业全面赋能,为区域内乃至全国生命健康行业的高质量发展贡献力量。

此外,面对医疗和生命健康行业的初创企业,亚马逊云科技还推出了“云创计划”,提供起步云资源和技术服务,以加速扶持初创公司在云上开启数字化创新之旅,实现高速成长。目前,亚马逊云科技累计支持的来自医疗和生命科学行业的初创企业数量已超过300家。(文/医谷 张蓉蓉)

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