实验员再也不“蛋疼”了,Transcriptic来帮你!

医疗健康 来源:动脉网 作者:baron
2015
04/22
09:52
动脉网
作者:baron
医疗健康

Transcriptic 是一家提供基于云服务的现代生命科学研究平台的外包服务商。也许你没有听说过,但如果清楚 Google 的医疗野心,就一定听说过它了。

Transcriptic 由一名生物医学工程专业的学生 Max Hodak 在毕业前夕创建,别看人年轻,在经验上真算是老手了。

Hodak 于2007 年进入美国杜克大学,正式成为一名生物医学工程专业的大学生。在创办 Transcriptic 之前,他的经验都是在大学期间积累起来的。他曾在2008年1月成立了一家教育管理公司 MyFit,经营不错,不过在融完A轮后,于第二年卖给了 Naviance。然后加入互联网公司PBworks 担任软件工程师,7个月后进入另一家公司Inporia做首席技术官,直到开启第二次创业。

选择成立 Transcriptic主要原因:

1.缘于他四年杜克大学医学中心研究助理的经历。他对在实验室用纸质笔记本记录实验数据的做法很不得劲,因为浪费研究人员大量时间用于查找相关数据。所以在当时,也就08年的时候,他将所有实验记录检索输入计算机,并编写了一个计算机软件,从而研究员可以方便地检索到所需要的内容。然而此举却没有受到共事者的欢迎,并认为只是在浪费时间。意外的是在一年半后,他发现很多当初的质疑者都在使用这个系统了。Hodak 回忆说,这是一个信号,鼓舞他在提高实验室效率问题上继续探索。

2.大学时代要做的作业就是研发机器人交互界面。Hodak 的日常任务就是建立猕猴大脑和机器人之间的交互界面。猕猴要去想怎么操作这些机器来完成任务,这样才能得到果汁喝。当 Hodak 自己做这些实验时,他发现自己还不如那些猴子。他说:“在生物实验室,你把所有时间就用于等待某个实验结果,这种感觉就是机器人”。

3.市场产品价格高昂且不灵活。一些大型生物技术公司已经建立了机器人实验室,让机器人去完成重复累人的工作。但是这套系统十分昂贵!而且这些机器人的程序不灵活,不能迅速转变为新的程序。

Let our robots do your science

在自我梦想追求与实现价值的基础上,于是也就有了基于云服务的机器人系统的诞生。

Hodak 团队总是用 “Let our robots do your science” 这句话介绍自己。

Transcriptic 致力于为资金有限、时间有限的研究人员服务,提供的是一个远程的机械生命科学研究实验室,这些实验室都配备了强大的运算能力,能够让从世界各个地方的人们都能操控这里的多个实验。简单点说,只要你有一台电脑,利用 Transcriptic 的云服务,你就可以在自己的电脑上运行复杂的生物医药研究程序,做实验模拟测试等。

用户首先利用 Transcriptic 的应用程序接口对实验进行编程,从而将实验方案的每一步转为机器可读的代码。随后,顾客指令和所有实物样本到达 Transcriptic 实验室处。实验在一个由树脂玻璃密封而成的工作站内进行,里面的台子上摆满了仪器,均由一台接收工作指令和操控各种机器的电脑“指挥”。台架上的机械手与工作站的长度一致,将培养皿在聚合酶链反应装置、酶标仪、移液器、冷藏箱、恒温恒湿箱等不同机器间传送,以此开展实验,用户可实时接收来自每个实验步骤的数据。

在 2013 年秋天,这家公司开始提供一些基础研究服务,如老鼠标本的基因分型、蛋白质定量和质粒构建等。到2014年夏天,他们发布主打产品“Robot-Run Biology Lab”。7 月,他们发布了一款云计算的平台“the Transcriptic Platform”,用户可以在线设计自己实验室的操作程序,再由 Transcriptic 的机器人去完成剩下的事情。

但是 Transcriptic 的抱负远不在于提供一个让机器人去操作的菜单,Hodak 希望能开放给任何复杂层次的用户。他们的想法是,创造出一套生命科学的“编程语言”,让实验室里的操作与计算机操作同步进行。今年将扩大产能并以多数从事生命科学研究的人都认可的低廉成本提供DNA克隆等服务。

通过这个编程系统,你可以收集一个试验里各种反应的数据,再给这些数据建模,从而可以预测你可选的各种参数。通过记录已有的试验数据,就可以让云平台去选择最好的程序来运行。即使某个反应出错,也可以自动选择新的参数试验。这样的话,就能创造出一个闭环的反馈循环,而不需要人的参与。

这项服务不一定就能吸引到大多数生物学家,但是对于新兴的生物数学家和生物技术初创者,它能够直接把实验室里的程序与数据连接起来。目前 Transcriptic 已经吸引了一些没有实验室经历的计算机科学家,他们只想要测试他们的生物数学模型,而不需要进生物实验室。

而大型的客户包括哈佛、斯坦福等学校,以及 Y-Combinator。与YC是去年12月达成的合作,其合作的任务是为YC公司带来年轻的生物技术公司的亚马逊网络服务,降低实际上花在基础设施上的成本。

市场同类竞争对手

除了 Transcriptic,也开始有其他一些公司让生物学家把基础工作外包给机器人实验室。就在 Transcriptic 发布云计算平台的时期,位于加利福尼亚的另一家实验室 Emerald Therapeutics 也提供了类似的服务“the Emerald Cloud Laboratory”,开发了如免疫印迹等应用。

在这个一站式网上商店里,顾客可定购实验项目、分析数据并同他人开展合作。从今年年初开始,用户能从40种常用实验方法清单中自主选择任何一种,比如用于蛋白质分析的免疫印迹法或分离混合物成分的高效液相色谱法。

在某种意义上,这些公司类似于传统的研究外包机构,但自动化系统和数据采集为科学家提供了更加细微的细节以及对实验设计的控制。或许有人认为,如此复杂的设备会让实验成本变高。

但 Hodak 表示,Transcriptic 提供的诸如克隆、诱发突变等实验项目和在学术实验室开展的成本几乎相同,甚至还要更少一些,并且这按需付费的价格约为传统研究外包公司开价的一半。部分原因在于 Transcriptic 的工作站无须人工操作员便能运行,有的两名全职工程师也主要负责找出程序漏洞和转换新任务。而且很多硬件都是公司自制的。

三年共筹1430万美元融资额

Transcriptic 到目前获得10家投资机构与多名投资者青睐,共计4轮融资,融资总额达1430万美元。其中 Google Ventures 参与两轮,值得注意的是,有超过60位投资者通过与投资平台 AngelList 和 SecondMarket 的合作关系提供了15万美元。Transcriptic 称其是第一个在互联网上获得如此大量融资的公司。

作为新生事物,难免让不少人观望和怀疑。而且由于目前技术的限制,也不是所有的实验操作都能实现自动化。但无论如何,机器人自动化实验室解决方案将是未来实验的主流方向,只是过程稍显冗长罢了。(动脉网vcbeat)

来源:动脉网   作者:baron

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