3月21日,NVIDIA宣布推出一整套用于自定义AI基础模型的生成式AI云服务BioNeMo ,这些服务将加速新蛋白质和治疗方法的创建以及基因组学、化学、生物学和分子动力学等领域的研究。
据了解,作为NVIDIA AI Foundations的一部分,BioNeMo云服务产品能够加速药物研发过程中最耗时、费用最高的阶段,研究人员能够依靠它在自己的专有数据上对生成式AI应用进行微调,并可以直接通过网络浏览器或者全新云应用编程接口(API)运行AI模型推理,并轻松集成到现有应用中。
同时,BioNeMo服务使用户可以通过一个浏览器界面轻松访问这些生成式AI模型,进行互动推理并实现蛋白质结构的可视化。研究人员将BioNeMo与NVIDIA DGX Cloud™上的超级计算资源组合后,就可以在使用NVIDIA Base Command™ 平台和NVIDIA AI Enterprise软件套件的全托管软件服务上自定义他们的模型。
另值得一提的是,BioNeMo加入了6个经过优化的全新开源模型,包括:
AlphaFold2:DeepMind开发的一个深度学习模型,其能够将确定蛋白质结构所需的时间从几年缩短到几分钟甚至几秒,仅需要使用蛋白质的氨基酸序列。该模型已经被100多万研究人员使用。
DiffDock:为了帮助研究人员了解药物分子如何与目标蛋白结合,该模型以高精度和高计算效率预测小分子的3D方位和锚定反应。
ESMFold:这个蛋白质结构预测模型使用Meta AI的ESM2蛋白质语言模型,可以基于单个氨基酸序列来预测蛋白质的3D结构,而不需要类似序列的样本。
ESM2:该蛋白质语言模型用于推理蛋白质的机器表示,对蛋白质结构预测、属性预测和分子对接等下游任务很有用处。
MoFlow:用于分子优化和小分子生成,这个生成化学模型重新创建分子,提出潜在治疗药物的各种化学结构。
ProtGPT-2:该语言模型生成新的蛋白质序列,帮助研究人员设计具有独特结构、属性和功能的蛋白质。
NVIDIA医疗业务副总裁Kimberly Powell表示:“生成式AI的革命性力量为生命科学和制药行业开辟了巨大的前景。NVIDIA与该领域先锋企业的长期合作,推动了BioNeMo云服务的发展。这项服务现在已经被当作一个AI药物研发实验室,它可提供预训练模型,并使用专有数据自定义服务于药物研发流程各阶段的模型。这能够帮助研究人员识别正确的靶向目标、设计分子和蛋白质并预测它们在人体内的相互作用,从而研发出最佳的候选药物。”
医谷获悉,世界领先的生物技术公司安进(Amgen)已经在使用BioNeMo云服务推进其研发工作。具体而言,安进使用其专有的抗体专利数据对BioNeMo的 ESM 模型架构进行了预训练和微调。该公司将在DGX Cloud上训练五个用于分子筛选和优化的自定义模型所需要的时间从三个月缩短到几周。
安进数字创新研究加速中心、生物治疗研发部执行总监Peter Grandsard表示:“BioNeMo大大加快了我们的生物制剂研发流程。凭借这项服务,我们可以在安进的专有数据上预训练用于分子生物的大型语言模型,使我们能够探索和研发出新一代药物中的治疗性蛋白质来帮助治疗患者。”
此外,NVIDIA 初创加速计划高级成员Insilico Medicine正在使用BioNeMo加速早期药物研发流程。该流程在过去需要花费四年多的时间,成本约5亿美元。Insilico使用了端到端的生成式AI,只用了三分之一的时间和十分之一的成本就能识别出一种临床前候选药物。该药物预计很快将进入二期患者临床试验阶段。
正如英伟达医疗业务副总裁Kimberly Powell所言,生成式AI的革命性力量为生命科学和制药行业开辟了巨大的前景。多年以来,英伟达都在与该行业的先锋企业积极合作,基于加速计算和先进AI技术加速医疗健康领域的研发与进步。
来源:医谷网
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