《Nature》子刊:GWAS一次性斩获12个高癌风险位点

医疗健康 来源:生物通 作者:欧阳沐
2017
06/13
16:56
生物通
作者:欧阳沐
医疗健康

国际睾丸研究协会(The international Testicular Cancer Consortium,TECAC)的研究人员在宾夕法尼亚大学Perelman医学院转化医学和人类遗传学教授Katherine L. Nathanson医学博士的领导下,与多个机构展开合作,最终获得了今日发表在《Nature Genetics》上的研究成果。该论文的第一作者是Zhaoming Wang,他在美国国立癌症研究所Stephen J. Chanock医学博士的指导下工作。

睾丸生殖细胞肿瘤(testicular germ cell tumor,TGCT)占睾丸癌病例的95%。在美国和欧洲国家,TGCT是20岁到39岁男性最常见的癌症,在过去的20年间病例数逐年上涨。尽管有明显证据表明,该肿瘤的易感性来自遗传,但是人们还没有找到一个类似乳腺癌BRCA1突变的外显率高的睾丸癌致病基因。

在此背景之下,用于鉴定疾病风险相关常见变异的全基因组关联研究(genome-wide association studies,GWAS)在这项最新的突出研究之中大放光彩。

Nathanson和她的研究团队使用GWAS分析术,发现了染色体上与TGCT风险增加有关的变异loci。他们结合了来自5个国际TGCT研究、将近3600个癌症病例的GWAS数据。

“我们发现了来自前所未知的染色体区域内的8个loci,”Nathanson说。“我们还发现了来自已知区域内的4个新loci。”

Nathanson指出,新位点的识别不仅仅具有统计层面意义,它们还具有生物学层面意义,暗示出特定途径的破坏,特别是涉及雄性生殖细胞发育、成熟和功能的途径。

“相比其他类型癌症,我们计算发现,TGCT的位点特异性遗传占比很高,但是loci位点数目较少。”

加上此次新鉴定的12个loci,目前已知的loci数目总数累计40个。Nathanson说,综合所有loci,大约37%的父亲传递给儿子的睾丸癌家族性风险将有据可循。

“尽管这种癌症可被治愈,但是此项新发现表明,关于这类特殊的疾病类型,我们仍需再接再厉,”Nathanson受。“基因组学发现可指导我们确定哪些病人处于高发病风险,哪些病人需要筛查,尤其对隐睾人群,精确的早期筛查更加有用。”

原文标题

Meta-analysis of five genome-wide association studies identifies multiple new loci associated with testicular germ cell tumor

来源:生物通   作者:欧阳沐

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