粪便，第二基因组！_医疗健康

2015

02/15

14:29

基因空间医疗健康

在渐行渐远的基因检测市场上，有着这么一个领域，被学术界称之为“第二基因组”。这是一个神秘的领域，不是因为它的名字，而是因为这是一个颠覆传统基因检测市场的产品。通过收集你的粪便，生物信息学家就可以破解你身体的健康信息，你准备好了吗？

“第二基因组”每分钟都在改变

人体的肠道生活着超过1000种微生物，这些微生物遗传信息的总和称为“微生物组”，因为这些肠道微生物与人体共生，同时疾病息息相关，例如自闭症、癌症和糖尿病等，所以被人们认为是“第二基因组”。这样的“第二基因组”每时每刻都在改变，微生物丰度的改变趋势也被发现对人体健康产生很大的影响。

这里有一个很重要的思路：第一，肠道菌丰度变化，能否反应出环境对个体健康的影响？简单来说就是“第二基因组”数据的解读；第二，改变肠道菌的丰度，能否影响个体的健康？这个思路就是“第二基因组”数据的应用。

传统的基因检测，更多的只是检测个人的遗传信息，然后通过易感基因和疾病的相关性来评估患病风险。除了针对突变DNA的基因检测，这种终身不变的基因检测往往只是一次性消费，并不能成为一种每天消费的必需品。但是，人体内的“第二基因组”却是每分钟都在改变，这是一种需要无间断性的进行监控和检测的数据。

uBiome的肠道菌检测产品价格只要89美金

谁在应用“第二基因组”？

许多公司已经开始为个人提供微生物数据的分析和解读。同时也有为医疗机构提供样本收集服务的非营利性组织。其中样本的收集和筛选，更多是的针对医疗的应用而进行的服务。

2012年，麻省理工大学博士后MarkSmith创办了一家非营利性组织的粪便银行OpenBiome，专门为医院提供粪便样本。OpenBiome要求粪便的提供者拥有健康的肠道菌群，同时需要保证粪便新鲜以维持细菌的活性。

2013年，一家叫做uBiome的公司在众筹网站Indiegogo上面融资10万美金，宣称可以通过生物信息技术从粪便里面收集人体内的微生物数据，从而分析出人体的健康状况。最后该公司筹集了35.1万美金的资金，不久以后，从天使投资公司继续募集了150万美金。借着几轮的投资，uBiome开始联合一些研究机构开展大规模的人体肠道和口腔微生物的数据收集。

目前应用“第二基因组”的思路和基因检测类似，一方面是数据的解读，例如uBiome的产品，另一方面是数据的应用，例如OpenBiome的样本收集服务，可以直接和医院进行对接产生应用的出口。

我们准备好了吗？

目前对于“第二基因组”数据的解读还存在很多的问题。uBiome的美女CEO Jessica Richman带着11人的团队和11人的科学顾问，一直受到公众的质疑，《科学美国人》博客中对于该公司的抨击甚至质疑Jessica的诚信度。据很多的用户反映，uBiome无法提供完善的数据解读，同时也不愿意开放数据结果给用户的健康咨询师和第三方的检验机构。

除了消费者通过产品自愿共享自己的肠道和口腔微生物数据以外，大规模的医疗机构对于公众的粪便进行数据收集，目前还是处于灰色地带。以粪便收集的医疗应用中粪便移植为例，美国食品药品监督管理局（FDA）还没有出台明确的管理制度，基本处于“睁一只眼闭一只眼”的态度。去年2月份，FDA发布了一个新的粪便移植指南草案，指南中提到，患者或者医生应该明确知道粪便的捐献者。但是，对于口腔微生物而言，未来要走上规范化还有一段很长的路要走。

尽管如此，塑造我们“第二基因组”的想法还是很吸引人的。目前我们已经知道，改变胖子的肠道微生物能够“变成”瘦子，分析肠道菌数据能筛查出大肠癌等。

同时公众需要知道，相关性不等于因果关系，研究中使用的小鼠肠道菌和人类还是差异很大的，目前技术对于微生物分类还没有达到解读需要的细致程度等。

只有知道这些，你还想要测自己的“第二基因组”，那就是准备好了。

来源：基因空间

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