Illumina推出HLA分型的新模式_医疗健康

2015

03/17

09:57

生物通医疗健康

人类白细胞抗原（HLA）区域为各种疾病和状况提供了重要的见解。不幸的是，由于此区域的高度多态性，HLA分型存在不小的挑战。近日，Illumina公司宣布推出TruSight HLA，这个方案通过测序11个HLA基因而全面查看HLA区域，带来准确的HLA分型。

TruSight HLA为高通量的HLA分型提供了一个从样品到报告的全面方案。它包括TruSight HLA Sequencing Panel（在单个分析中实现对所有关键基因的高分辨率分析），制备和测序DNA文库所用的试剂，以及经过优化的数据分析方案。

HLA在人体识别侵入性的细胞和介导免疫反应上发挥重要作用，从而帮助对抗疾病，保持人体健康。然而，此区域存在高水平的序列同源性以及密集的变异，故研究起来难度颇大。传统的分型方法需要10-20次分析，才能实现高度可信的HLA分型，而这一结果是基于6,500 bp的DNA序列。TruSight HLA仅仅采用一次分析，就能根据65,000 bp产生结果，序列覆盖度高了十倍。

TruSight HLA在MiSeq测序仪上开展，利用了Illumina的边合成边测序技术。凭借长距离PCR和HLA特异的Nextera? 文库制备技术，在单个分析中实现高度准确、不含糊的HLA分型。一次分析带来全面的结果。此外，独特的多重分析能力实现了样品合并，能同时分析多达24个样品。

根据TruSight HLA的流程，一开始利用位点特异的引物开展长距离PCR，扩增HLA基因。接着，为HLA分型而优化的快速文库制备步骤将扩增后的DNA转化成带有接头的文库。DNA的Nextera tagmentation同时对DNA进行片段化和标记，而不需要机械剪切。整合的样品条形码实现了单次测序运行中最多24个样品的合并。接着，文库被变性成单链DNA，并立即上样到MiSeq系统上进行测序。HLA位点被测序成高质量、2x 250 bp的双端序列，能够利用密集的多态性来准确分配相位。这样，从测序数据中可直接推断明确的HLA分型结果。从样品到报告，整个过程可在3.5天内完成。

TruSight HLA的上市，不仅为研究人员提供了一个快速、可靠且更加全面的HLA测序方法，也证明了Illumina的测序技术能应用在新兴市场上，揭开人类基因组的奥秘，为人们的生活带来积极的影响。此产品现已开始发售。

来源：生物通

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