33种癌症、超11000份肿瘤样本，癌症基因组深入分析出炉

日前，由美国国立卫生研究院（National Institutes of Health，NIH）资助的研究人员已经完成了一项名为“Pan-Cancer Atlas”的详细的基因组分析，并以27篇论文集形式发表在《Cell》系列杂志上。

研究分析了来自33种最常见癌症的超过11000个肿瘤样本的分子和临床信息数据，这是迄今为止最全面的跨癌症分析，也是癌症基因组图谱（The Cancer Genome Atlas, TCGA）项目的最终成果。

Pan-Cancer Atlas项目启动于2005年，由NIH资助，耗费高达3亿美元，由其下属的两个单位：国家人类基因组研究所（National Human Genome Research Institute，NHGRI）和国家癌症研究所（National Cancer Institute，NCI）共同来执行，来自北美20多家机构的超过150名研究人员参与了该项目，希望通过基因组学分析技术来将人类所有的癌症基因描绘出来。

TCGA的各项关键数据（图片来自CellPress）

NHGRI基因组学部门主任Carolyn Hutter博士表示，除了癌症基因组测序，Pan-Cancer Atlas还综合了各种组学数据，例如肿瘤的转录组、蛋白组、甲基化组学、临床以及影像方面的数据。

“这个项目是十多年来开创性工作的成果，”NIH主任Francis S. Collins博士说道，“这项分析有助于癌症研究人员更好的了解肿瘤在人体内如何产生、何处产生、为何产生，从而为未来的临床试验和治疗带来启示。”

Pan-Cancer Atlas分为三个主要类别，主要的研究专题包括细胞起源、致癌过程和致癌途径。每个专题包括一篇对该专题核心发现成果的综述，以及数篇深入探索深入各个子主题的相关论文。

在第一篇综述论文中，作者总结了一系列分析的结果。通过应用分子聚类分析技术，对基因测序结果分析进行总结，此分析技术主要是通过基因表达、肿瘤细胞染色体数目异常和DNA修饰等参数来对肿瘤进行分组。研究结果表明，肿瘤类型是由其可能的起源细胞组成的，这一结果增加了对肿瘤组织的起源对癌症特征的影响的认知，并有助于研究人员对不同类型的癌症进行更具针对性的治疗。

第二篇论述概述了“TCGA”在导致癌症发展和进展过程中的重要成果。该一系列文章集揭示了生殖细胞遗传变异体与癌症进展中体细胞突变之间的协作，以及突变对细胞信号传导和免疫细胞组成的影响，这为优先开发新疗法和免疫疗法提供了一定的见解。

其他所有论文可以通过cell.com的门户网站获得。

生长的癌细胞（紫）被健康细胞（粉红）包围，说明了原发性肿瘤通过循环系统传播到身体的其他部位。（图片来源：Darryl Leja / NHGRI）

初步的研究表明，起源于不同器官的癌症实际上在分子层面可能具有诸多共性，而来自同一组织的癌症却可能有着截然不同的基因组图谱。在专家们看来，这些分析结果与大量临床研究结合了起来，这个项目将直接造福于癌症研究与癌症新药的开发。“现在是重写癌症教科书的时候了，癌症分类发生了范式转换，要打破过去临床肿瘤学的桎梏。”加州大学旧金山分校（UCSF）的癌症与发育疗法项目主任 Christopher Benz教授评论道。

论文检索

http://www.cell.com/pb-assets/consortium/pancanceratlas/pancan/index.html