11月22日,百度和赛诺菲宣布双方达成合作,将百度自主研发的mRNA序列设计优化算法LinearDesign整合到赛诺菲的产品设计管线,用于mRNA疫苗和药物开发。
据悉,百度在2018年便开展了RNA二级结构领域的研究,在2020年4月推出LinearDesign mRNA序列优化算法,专门用于mRNA序列设计。目前,mRNA技术虽然已被成功商业化,但mRNA疫苗普遍稳定性低,容易因降解而失效,成为影响其储存、运输和免疫原性的主要限制因素。LinearDesign则通过动态规划算法,将序列稳定性和蛋白质翻译效率指标进行联合优化,可在10分钟内找到比天然序列更加稳定且蛋白质表达水平更高的新冠mRNA疫苗序列,真正实现了在最短时间内用最高的效率得出最优化的方案。
目前,LinearDesign算法在提高编码蛋白的稳定性和免疫原性方面的有效性已在体外和体内实验中得到验证。2020年8月,百度与斯微生物达成合作,基于LinearDesign算法开展mRNA疫苗分子的体内和体外试验,并与基于传统方法设计的基准序列进行了头对头的对比。2021年10月,实验结果公布:在稳定性、蛋白质表达水平以及免疫原性等多个衡量疫苗的重要指标上,LinearDesign设计的新冠疫苗序列均大幅优于传统方法设计的基准序列,尤其在抗原中和抗体滴度这一衡量疫苗有效性的关键指标上,LinearDesign设计的序列最高超过基准序列达到20倍,表示LinearDesign设计的疫苗能够有效产生免疫保护;其实际有效性和应用于生物制药领域的巨大价值被充分验证。
百度LinearDesign算法设计的七条疫苗序列(A-G)以及基准序列(H)等相关信息
百度表示,mRNA与生物计算的结合将使得这一进程更加快速、高效,并可能为未来的药物研发提供全新思路,同时,除了应用于新冠mRNA疫苗研发,LinearDesign还能用于传染病疫苗、肿瘤疫苗、单抗等各种疫苗和药物的研发。
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